Les ressources biologiques des monts sous-marins sont en outre potentiellement menacées par l'extraction des agrégats de ferromanganèse; les sources hydrothermales peuvent être endommagées par l'extraction des sulfures polymétalliques, les bactéries présentes dans les hydrates de gaz par l'activité extractive, et tous les organismes vivant sur le fond de l'océan ou sur les nodules polymétalliques par l'extraction de ces nodules.

海隆资源也可能受铁锰结壳开采威胁，而热液喷口可能受多金属硫化开采破坏，气体水合中细菌受了采损害。 在洋底或多金属结核中发现任何，都可能因这些结核开采而受损害。