Entre las atrocidades se señalan matanzas generalizadas, violencia sexual, tratos crueles, inhumanos y degradantes, desplazamiento forzados y conversiones forzadas.
Colville habló de la situación en El Salvador donde se están tomando medidas " extremadamente duras" que pueden constituir trato cruel, inhumano y degradante.
Florence trató de ennoblecer el oficio considerado entonces degradante e intuyó que en su base había dos aspectos esenciales, la preparación y la higiene.
Victor Madrigal-Borloz asegura que son prácticas " intrínsecamente degradantes y discriminatorias" y que resultan en daños psicológicos y físicos que pueden llegar a ser permanentes.
La Misión ha documentado 122 casos de víctimas que fueron sometidas a tortura, violencia sexual y otros tratos crueles, inhumanos o degradantes perpetrados por agentes del DGCIM.